根據水質分析結果，針對可能造成堵塞的主要原因，應對滴灌水源采取不同的措施進行水質處理。概括起來講，滴灌水質處理方法可以歸結為物理的和化學的兩大類。物理處理是從水中除去粒徑大雨系統中小孔徑1/10~1/7的所有有機和無機雜志；化學處理則是往水中加一種或集中化學藥劑以控制生物生長 和不利的化學方音，改變灌溉水的化學特性。物理處理和化學處理可以分別進行，也可同時進行或互相配合。